عصر یخبندان در حال پایان یافتن است. سه قهرمان قسمت پیشین- سید، مانی و دیه گو - که متوجه خطر زیر آب رفتن منطقه زیست خود و در نتیجه نابودی حیوانات شده اند، تصمیم می گیرند تا قبل از آب شدن یخ ها خود را به منطقه ای امن برسانند. آنها در طول راه با الی- یک ماموت ماده- و دو همراه وی کرش و ادی برخورد می کنند. الی که از کودکی با آن دو بزرگ شده خود را اُپوسوم می پندارد و تلاش مانی برای قانع کردن او فایده چندانی در بر ندارد. چون مانی قصد دارد به همراه او خانواده ای تشکیل داده و نسل ماموت ها را از انقراض نجات دهد. آنها در طول راه با حوادث زیادی روبرو می شوند، از جمله خطر خورده شدن توسط دو جانور دریایی که از درون یخ های ذوب شده بیرون آمده اند، اما سرانجام با رسیدن به مکانی امن و نجات الی توسط مانی همه چیز به خوبی و خوشی تمام می شود. اما اسکرات بیچاره در پایان این قسمت نیز موفق به دستیابی به بلوط محبوب اش نمی شود ...